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DNA  
勤俭节约是美德 相对于真核生物(高等动植物),原核生物(细菌等)表现得非常节俭,这是与他的生存环境分不开的。真核生物生存能力强,有的能够自己选择环境,比如说动物。而原核动物就没有这么好的生存条件了,成天 ...
Blastp/PSI-Blast/PHI-BLAST都是蛋白序列与蛋白序列之间的Blast比对。 1,Blastp: 标准的蛋白序列与蛋白序列之间的比对Standard protein BLAST is designed for protein searches.Blastp用于确定查询的氨基酸序列在蛋白数据库中找到相似的序列。跟其它的Blast程序一样,目的是要找到相似的区域。 2,PSI-BLAST : 敏感度更高的蛋白序列与蛋白序列之间的比对PSI-BLAST is designed for more sensitive protein-protein similarity searc ...
一、数学统计方法数学统计在生物信息学中是一种最常用的方法。例如,在分析DNA语言中的语义、分析密码子使用频率、利用马尔可夫模型进行基因识别。 二、动态规划方法动态规划(Dynamic Programming)是一种通用的优化方法,其基本思想是:在状态空间中,根据目标函数,通过递推,求出一条从状态起点到状态终点的最优路径(代价最小的路径)。动态规划在生物信息学研究中用得最多的方面是DNA
1.1 序列相似性比较 生物信息学中,对各种生物大分子序列进行分析是一件非常基本的工作。从序列的片段测定,拼接,基因的表达分析,到RNA和蛋白质的结构功能预测,物种亲缘树的构建都需要进行生物分子序列相似性的比较。在遗传物质长期的演化过程中,原本相同的DNA序列由于其中一条序列缺失了几个片断,或增加了几个片断,或某段子序列发生了位置的变化等,从而导致他们发生了不同,这两条序列不一定能进行精确的匹配,但是他们有一定的相似度。我们应该如何判定序列之间的这种相似性?对于这种情况,生物学家提出了一种用来评定序列相似性的方法,称为记分函数的方法。 定义1:如果是一个序列,那么表示中的字符长度,表 ...
综合数据库 ★ INSD,国际核酸序列数据库(International Nucleotide Sequence Databank)。由日本的DDBJ、欧洲的EMBL和美国的GenBank三家各自建立和共同维护。 ★ EMBL库,欧洲分子生物学实验室的DNA和RNA 序列库。 http://www.ebi.ac.uk/embl.html ★ GenB ...

常用单词

CNS    中枢神经系统 AJC    解剖学 Ka是酸性物质电离平衡常数(碱性是Kb) 对于一种酸HnM Ka=([H]n[M])/[HM] HnM中的n是下标,[H] (n)[M]中的n是上标(也就是n次幂) pKa=-lgKa Kb=Kw/Ka pKb=14-pKa pKa——是弱酸性或弱碱性物质在50%解离时溶液的pH值。
Analysis of Polar Compounds in Biological Matrix with LC/MS/MS via “Normal Phase” LLE for Sample Preparation authors Kristopher W. King, Chris Tran, Guangyu Zhao, Ling Morgan Tandem Labs, New England introduction Three sample preparation techniques are commonly used to extract analytes out of biolo ...
通用的生物信息学门户 www.ncbi.nlm.nih.gov 美国国家生物技术信息中心主页。是关于公开数据库、生物信息学工具盒应用的资源,链接了许多有关生物信息学软件的有用站点和资源 www.ebi.ac.uk EMBL欧洲生物信息学研究分支,生物学数据库和软件资源,其中大部分有精彩的教程支持 www.expasy.ch ExPAS(expert protein analysis system,专家蛋白质分析系统)分子生物学服务器。由瑞士生物信息学研究所(SIB)维护,提供有关分析蛋白质序列,结构和表达的链接,数据库和软件资源 www.embl-heidelberg.de 欧洲分子生 ...
转:http://www.druggcp.net/htmls/17.html        CRO即合同研究组织,是一种学术性或商业性的科学机构。研发者可委托其完成临床试验中的某些工作。一个全面的CRO可提供的服务包括临床前试验(如动物实验、体外组织实验)、临床 ...
CRO(Contract Research Organization):合同研发组织,一般称之为"生物医药研发外包"。 出现于上世纪80年代,一种学术性或商业性的科学机构。申办者可委托其执行临床试验中的某些工作和任务,此种委托必须作出书面规定,其目 ...
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